黒猫の旅〜過去から未来まで〜: 9月 2013

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Nature Geoscienceからリジェクト、その反省と分析

昨晩、先生から「残念です」とのメールが。

僕が筆頭で書いていた論文のリジェクト（掲載拒否）の知らせでした。

Nature Geoscience誌に投稿してから10日以上が経過し、「便りがないのは逆にいい知らせ…これはreviewに回るかも…」と先生や他の共著者の方々と期待に胸を膨らませていたのですが、残念ながら今回は力及ばず。

反省の意味もこめて、編集者からのコメントを振り返って、どこがダメだったのか考えてみたいと思います。

メールの本文はここでは載せることはできませんが、非常に丁寧な文体で（おそらく数多くのリジェクトになった研究者に送るためのテンプレートだとは思いますが）、後半に少しだけ論文の内容に触れた部分がありました。

一応投稿された論文のほとんどにはきちんと目を通しているのかな？という印象を持ちましたが、後半の方で「最近は投稿数も非常に多く、また発行できる論文数にも限りがあることから…」などと、返答が遅れたことに関しても謝罪の文がありました。

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※補足
The paper trail

2014年1月号のNature Geoscience誌の社説で、投稿された論文がどのように査読プロセスを経たかを説明したもの。2013年には2,000件を超す投稿があり、うち受諾されたのはわずか「177」件。
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Nature誌（姉妹紙含む）の最大の特徴としては、

アクセプト（受理）率が非常に低いこと（目安14本に1本）
科学的に飛躍的な進歩が期待され、より広い分野に影響を及ぼしうる研究結果であることが求められる

が挙げられるでしょうか。（参考：「科学嫌いが日本を滅ぼす〜ネイチャー・サイエンスに何を学ぶか」竹内薫）

今回、僕らの研究がリジェクトになった理由は２つ目の特徴と大きく関係があります。

これは共著者であるPDからも投稿前に指摘されたことですが、「この研究結果がなくても、先行研究だけで話が作れて、科学的な進展はそんなに大きくない。驚きもそれほど大きくない」ということ。

研究に使っている試料は世界でも指折りの一級品（特に統合深海掘削計画：IODPのものなので数億〜の国費が投入されている）
国際的な交渉の席で先生が試料の取得にかなり腐心し、極めて良質な試料が得られた
研究に用いた測定手法も世界最高水準
分析そのものが困難であり、研究手法の開発には数年を要した（僕自身２年かけてようやく取得できた、なけなしのデータ）

この辺りが僕らの推しどころであり強みなのですが、ただ、それはもちろん論文には基本的には記載はされていませんし、雑誌の編集部にとってみれば判断材料にも挙がらないのかもしれません。

出版社はあくまで学会に影響を与える雑誌を多く掲載することでお金を稼ぐ営利団体なので、そのあたりの背景はほとんど意味をなさないということなのでしょう。

それは科学に厳しく、極めて広い読者層を持つNature誌だからこそ、ともいえます。

逆に大型プロジェクト（惑星探査計画など）が載りやすいScience誌などをはじめからターゲットにしておいた方が正解だったのかもしれない…仮定の話ですが。

ある意味で、測定値が得られた段階で、既にNature誌に載るかどうかの分かれ道が決まっていたとも言えます。

そう考えると、偶然性も関係してくるので、今回のリジェクトに対する悲壮感が多少軽減されます（いい地質学試料に巡り会うかどうかも、結局運次第…的な）。

結局のところ、考察や解析手法の新規性にはほとんど価値を見い出してもらえず（プロジェクト自体は僕が研究室に配属される以前から走り始めていたので、ここが僕の貢献できた箇所です）、共著者の懸念が正しく、我々が今回新たに得た結果がすべてだったわけです。

これがもし、「分析技術の飛躍的な向上によって初めて見分けることのできた新事実が浮かび上がった」

だったらどうだったのでしょうか？それはかなりいい推しどころです。

しかし、それを全面に押し出せるほどにはまだ手法そのものに不確実性が大きく、さらに大きな自然変動もそれを隠してしまうと思います。

或いは

「データそのものの新規性よりも、解析手法を変えて先行研究を否定する結果が得られた」

「別の独立した解析手法を用いて、先行研究で示唆された推定をいっそう補強する結果が得られた」

というのであれば？

これらは一番分かりやすいアピールの仕方だと思います。

ただし、今回僕らが得たデータは、’残念なことに’先行研究と非常に整合的な記録でした。

今回用いられた手法は、細部は厳密には違いますが、大きくは同じ同位体（δ11B）を用いた手法であって先行研究とほとんど変わりありません。

僕ら地球化学者は新たなデータを取得することが基本的な仕事であり、これまでのデータのコンパイルではあまり評価されません。

データが何を物語っているかを最終的に判断するのは人間ですが、結局のところ試料は自然物であって、真理との巡り会わせには先見の明だけでなく偶然性も大きく関与します（もどかしいことに）。

また2003年と2010年に似た研究手法、近い研究対象地で既に先行研究があったのも今回のリジェクトの原因の１つとコメントにありました（2003年のものはScience誌に論文が掲載）。

しかし逆にその２例が先に道筋を示してくれていなければ、僕が解釈を深めることが難しかったのも事実です。

でも結局それが編集部が僕らの研究を評価するに至らないと判断した最大の理由です。

解釈や書き方ももちろん重要。だけどもっと重要なのはデータそのもの。

今回得た教訓です。

引用文献の書き方（Elsevier編）

最近後輩に質問されたのと、自分でElsevier社の雑誌に向けた投稿論文を作成しようと思っているので、ここでElsevier社の引用の書式例などをもとに、引用の書き方（並べ方？）を解説しておこうと思う。

Elsevier社の場合、
著者名（単著or共著）, 発行年. 論文タイトル. 論文掲載雑誌名巻数, ページ始まり–ページ終わり.
という並び。

○具体例

通常の論文（単著）:
Foster, G.L., 2008. Seawater pH, pCO₂ and [CO₃²⁻] variations in the Caribbean Sea over the last 130 kyr: a boron isotope and B/Ca study of planktic foraminifera. Earth Planet. Sci. Lett. 271, 254–266.

通常の論文（共著）:

Yokoyama, Y., Lambeck, K., De Deckker, P., Johnston, P., Fifield, L.K., 2000. Timing of the Last Glacial Maximum from observed sea-level minima. Nature 406, 713–716.

Yokoyamaさん他が「Timing of the Last Glacial Maximum from observed sea-level minima」というタイトルで2000年のNature誌（第406巻の713–716ページ）に書いた論文の引用

人名はイニシャルが前に来る場合もあるが（Y. Yokoyamaなど）、通常はLast name (Family name)が前で、コンマを挟んでFirst nameがあとの場合が多い。これは雑誌のスタイルによる。
人名と人名の間は’コンマ’で区切る。
「De Deckker, P.」だったり「De Pol-Holz, R」だったり「Bronk Ramsey, C」だったり「van de Flierdt, T.」だったり…どこまでがLast nameにあたるのか日本人には判断しかねる場合も。
発行年は名前の直後に来る場合と、一番最後に括弧書きする場合がある。これもまた雑誌のスタイルによる。
論文が掲載されている雑誌の名前はEarth Planet. Sci. Lett. = Earth and Planetary Science Lettersのように略す場合も。雑誌のスタイルによるが、雑誌側が最後のプロセスで編集してくれるとの話も（※要確認）
雑誌の名前のあと、雑誌の巻数：Volume、（まれに号：Issue）、掲載ページと続く。最近ではそのあとに「doi:」を続けることが推奨されているのだとか。
通常は雑誌名は斜体（イタリック）、巻数は太字（ボールド）で記載する。Elsevierはそうはしないみたい
ページの間の棒は「–」（「-」ではない）。Macの場合「option」＋「-」で表示できることをいま知った。

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他にも本や本の中のチャプターを引用したい時は以下のスタイルに合わせる。

本を丸まる一冊:
Strunk Jr., W., White, E.B., 2000. The Elements of Style, fourth ed. Longman, New York.

本の中の一つのチャプターなどを引用するとき:
Mettam, G.R., Adams, L.B., 2009. How to prepare an electronic version of your article, in: Jones, B.S., Smith , R.Z. (Eds.), Introduction to the Electronic Age. E-Publishing Inc., New York, pp. 281–304.
JonesさんとSmithさんが2009年に書いた、「E-Publishing Inc.」というニューヨークに籍を置く出版社から発行された「Introduction to the Electronic Age」という名前の本の281–304ページにある、MettamさんとAdamsさんが執筆を担当した「How to prepare an electronic version of your article」という名前のついたチャプターの引用

チャプターのタイトルだけでなく、もとの本そのものの名称や編集者（Editor）の名前も記載する。
通常、出版社とその本籍地も記載する。
本の引用の場合、「第何版か」も重要なのでthird ed. (Edition)やfourth edなどと記載する。

2013年9月17日火曜日

2013年9月16日月曜日

2013年9月15日日曜日

2013年9月14日土曜日

氷期に氷結点近くまで下がっていた深層水の温度、そしてMPTのメカニズムとは？（Elderfield et al., 2012, Science）

Evolution of Ocean Temperature and Ice Volume Through the Mid-Pleistocene Climate Transition
H. Elderfield, P. Ferretti, M. Greaves, S. Crowhurst, I. N. McCave, D. Hodell, A. M. Piotrowski
Science 337, 704-709 (2012)

とその解説記事

Ice Sheets in Transition
Peter U. Clark
Science 337, 656-658 (2012) "Perspective"

より。

ニュージーランド沖のChatham Riseから得られた堆積物コア（ODP1123）の底性有孔虫δ¹⁸OとMg/Ca分析を通して、過去1.5Maの深層水の温度・氷床量の変動とその変動メカニズムを考察。

2013年9月12日木曜日

気になった一文集（English ver. No. 17）

a future without a GRACE mission in orbit would be an unfortunate and unnecessarily risky backward step for regional water management.
地球の軌道にGRACEが存在しない未来は不幸であり、地域的な水資源管理にとっては不必要にリスクの高い後退となるであろう。

「Water in the Balance」Science 340, 1300-1301 (14 June 2013) "Perspective"

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Telling an optimistic story, by using the language of solutions, transitions and resilience, is more persuasive and more likely to promote useful action. Similarly, extreme weather events such as hurricanes and tornadoes capture the public’s attention in a way that decades of warnings about global warming have failed to do — notwithstanding that the connection between the two is complex.

If we want action on energy transition and combating climate change, we must offer concrete and viable solutions — no money goes to problems, only to fixes. We should advocate solutions in an upbeat, tractable way, tailored to particular world views.

Why have these local approaches worked? People like feeling that they are part of the solution, instead of being hostage to intangible problems such as oil dependency and climate change. They seize on things that give them hope and optimism. Capitalizing on these feelings should be a common objective of those who seek sustainable solutions.

I believe that these local measures must be championed to move us away from dependency on fossil fuels and towards renewable energies, and away from personal vehicles to public transport. Instead of agitating for indirect and punitive policy mechanisms such as carbon taxes, we should be advocating feed-in tariff schemes that encourage renewable energy, better rail networks, bicycle-friendly streets, local-food production, and improvements to the efficiency of our built environment.

Messages about climate change and energy that use fear- and threat-based tactics have not mobilized responses.

「Positive energy」Nature 498, 293–295 (20 June 2013) "COMMENT"

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The question of what drives changes in the deep ocean circulation is a fascinating and open research topic in modern oceanography and one where paleoclimate studies could help provide an answer in the future.

「The Role of Deep Ocean Circulation in Setting Glacial Climates」Jess F. Adkins, 2013, Paleoceanography
古海洋学と将来の気候変化

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In a world that strives for continued economic growth, moving the energy infrastructure away from fossil fuels is a challenging task.
依然として経済的な成長を望む世界においては、エネルギー・インフラを化石燃料から遠ざけることは難しい課題であろう。

Air capture could address automobile and airplane emissions inaccessible to point-source CCS. It could also remove residual emissions from point-source capture.
CO2の大気捕獲はある固定点の大気捕獲・貯留では手の届かない、自動車や飛行機からのCO2排出についても取り組むことが可能である。また捕獲を免れたCO2をも捕獲することができる。

「The urgency of the development of CO₂ capture from ambient air」Klaus S. Lackner et al. PNAS 109, 13156-13162 (14 August 2012) "PERSPECTIVE"
大気からCO₂を直接捕獲する技術はもっとも安全に気候変化を緩和できる可能性がある

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Changes to the energy system depend on what re-election-oriented politicians are willing to do — they would not pass laws that are not supported by their constituents — and on what consumers in the marketplace are willing to accept: will they pay for hybrid cars or energy-efficient light bulbs? Therefore, when it comes to energy, the role of citizens is critical.
エネルギー・システムの変化は「再選に躍起になる政治家が何をしたいか（彼らは有権者が支持しないような法律を通そうとは思わない）」や「市場の消費者が何を容認するか（彼らはハイブリット自動車やエネルギー効率の良い電球のためにお金を払うだろうか？）」に依存する。従って、エネルギーということになると、市民の役割は重要である。

Consistent with the few previous studies on other topics such as affirmative action, hate group speech and urban sprawl, the researchers find that opposite and equally strong frames cancel out, therefore appealing to the economic or national security benefits of clean energy does nothing to increase support when countered by the opposing frame — economic or national security risks.

「Stunted policy support」James N. Druckman, Nature Climate Change 3, 617 (2013) "NEWS AND VIEWS"
市民の意見もまた政治家の決断に影響

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In 2007, when the latest Intergovernmental Panel on Climate Change assessment was published, the global warming debate seemed to be over.Climate models simulated the observed warming of around 0.2 °C per decade, but only if the effects of greenhouse gases were included. The observations were well within the model uncertainties and a similar rate of warming was predicted for the future. However, it is now clear that the rate of warming has slowed substantially over the past 15 years or so and the observations are very much at the lower end of model simulations.

For example, a cooling could be caused by a downturn of solar radiation, or an increase in the radiation reflected back to space by aerosol particles in the atmosphere. Aerosols increase temporarily after volcanic eruptions, but are also generated by pollution, especially sulphur dioxide from industry. These factors are referred to as external because they are imposed on the climate system, which consists of the oceans, atmosphere, land and cryosphere. However, climate also varies internally without any changes in external factors. Examples of such natural internal variability include the El Niño–Southern Oscillation, which causes the tropical Pacific to warm and cool every few years, and decadal variations in the strength of the ocean currents in the Atlantic Ocean. Both of these affect the climate worldwide, including globally averaged temperatures.

Global warming will therefore not proceed monotonically; indeed, the historical record shows periods where temperatures rose rapidly, such as the 1920s to 1940s and 1970s to 1990s, and periods with little warming or even cooling, such as the early twentieth century and the 1940s and 1960s. Many of these historical periods can be explained by major volcanic eruptions, changes in solar activity or anthropogenic aerosol emissions, and are well simulated by models.
従って、地球温暖化は単調には進行しないのである。実際、歴史記録は温度が急速に上昇した時期（1920-40年代、1940-90年代）や、それほど温暖化しなかった・或いは寒冷化さえした時期（21世紀の初め、1940年代、1960年代）が存在したことを示している。これらの歴史的期間の多くは大きな火山噴火・太陽活動の変化・人為起源のエアロゾル排出などによって説明されており、モデルによってもうまく再現されている。

「Has global warming stalled?」Doug Smith, Nature Climate Change 3, 618–619 (2013) "NEWS AND VIEWS"
近年温暖化の速度が低下していることの原因の考察

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The cost of natural disasters in terms of life and property is, by some measures, on the rise. Climate and weather variability in the form of droughts, floods and damaging storm effects, is regularly inflicting suffering around the world, often disproportionately affecting developing countries and possibly contributing to violent regional conflicts.
生命と財産という観点では自然災害のコストは幾分か上昇傾向にある。干ばつ・洪水・破壊的な嵐という形で現れる気候と気象の変動は世界中で日常的に苦しみをもたらしており、しばしば不釣合いに途上国に影響しており、おそらく地域的な暴力的争いにも関係している。

However, climate and weather are strongly influenced by chaotic processes, which subject predictions to errors and uncertainty. Moreover, whether by lack of proper institutions and procedures or simply because of human reluctance to act, the dire consequences of extreme events are often unavoidable even when they have been successfully predicted. Such constraints, amongst others, should be borne in mind particularly when contemplating intervention to prevent disasters through geoengineering.
しかしながら、気候と気象はカオス的な過程によって大きく影響されるため、その予測は大きな誤差と不確実性を伴う。さらに「適切な機関と手続きが存在しないか」、或いは「単に人が行動したくないか」が原因で、たとえ異常気象の予測が成功していたとしても、それがもたらす悲惨な結果はしばしば避けられない。特に地球工学を通して災害を防ぐために（地球システムへの）干渉を考える際には、そうした制約を、他の制約よりも特に意識すべきである。

「Volcanic rain shift」Yochanan Kushnir, Nature Climate Change 3, 619–620 (2013) "NEWS AND VIEWS"
成層圏へ注入される火山灰の南北の非対称性が熱帯域の降水バンド・モンスーンに影響する

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The temperature differential is the engine that drives the spectacular summer deluges in South Asia known as the Indian monsoon—or so say textbooks. A new spate of research is challenging exist ing dogma, sparking a debate over the Tibetan Plateau’s role in the Indian monsoon. How it’s decided could have effects reaching far beyond the climate science community.

「Monsoon Melee」Jane Qiu, Science 340, 1400-1401 (21 June 2013) "NEWS FOCUS"
「モンスーンの原因はチベット高原における加熱だ」という従来の考えに疑問が投げかけられている。

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The question arises, what is causing the Northern Hemisphere land biosphere, especially at high latitudes, to go into hyperdrive? Surely, the biosphere must be enjoying the warming. Satellite observations show that from 1982 to 2011, the photosynthetic season has been lengthening over the past three decades: On average, the onset of greening of northern ecosystems (>45 N) has advanced by 1 day per decade in the spring, and the seasonally integrated photosynthesis has increased, consistent with the warming and thawing.

The authors hypothesize that observed changes in the structure of the biosphere—for example, northward migration of the tree line, increased shrub cover in the Arctic, and reestablishment of forests after fires—have enhanced carbon uptake to the extent necessary to explain the amplitude trend.

Permafrost carbon dynamics is just beginning to be incorporated into the next-generation models. Still, understanding of the transient carbon dynamics of a thawing Arctic is rudimentary.
永久凍土の炭素動態は次世代のモデルに取り込まれ始めたばかりである。依然として、融けつつある北極圏の過渡的な炭素動態の理解は初期段階である。

The biosphere is changing, and changing rapidly. Currently it is a sink for a quarter of the anthropogenic CO₂ emissions. Will it continue to act as a sink for fossil fuel–derived CO₂? Current results, including those reported by Graven et al., suggest that it will do so until microbial respiration overtakes photosynthetic uptake. The race is on.
生物圏は変化しつつあり、急速に変化している。現在では人為起源CO2排出の４分の１を吸収している。生物圏は化石燃料由来のCO2の吸収源であり続けるのだろうか？Graven et al.いよって報告されたものを含む最近の研究結果は、微生物呼吸が光合成による炭素取り込みを上回るまで吸収源であり続けることが示唆されている。レースは始まっているのである。

「A Hyperventilating Biosphere」Inez Fung, Science 341, 1075-1076 (6 September 2013) "PERSPECTIVE"
近年、大気中のCO₂濃度の季節変動幅が大きくなりつつあり、その原因は北半球高緯度の陸上生態系に求められている。

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Asking nations to reduce their greenhouse-gas emissions is apparently asking too much: there is no sign of a downturn in global CO₂ emissions.

But judging from past developments, zero global emissions look unachievable, at least in the next few decades: so far, we haven’t even been able to stop rates of CO₂ emissions from continuing to increase. In this situation, carbon capture and storage — the idea of stripping CO₂ from exhaust fumes before they enter the atmosphere, and storing the gas in a safe place — could be the only solution.

Capacities for geological storage are uncertain, pilot projects for deep-ocean sequestration have been halted, and public acceptance of both options is at best questionable — not least because full risk assessments based on solid scientific data are scarce. These questions need to be addressed sooner rather than later, if carbon sequestration is to become the solution for the climate problem.

「Saved by sequestration?」Nature Geoscience 2, 809 (2009) "Editorial"
炭素捕獲・貯留技術が気候変化緩和の最善の・最終手段かもしれない。

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黒猫の旅〜過去から未来まで〜

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2013年9月27日金曜日

新着論文（Science#6153）

2013年9月26日木曜日

新着論文（Nature#7468）

2013年9月22日日曜日

新着論文（PNAS, Ncom, SR）

新着論文（Science#6152）

2013年9月19日木曜日

新着論文（Nature#7467）